鉄道は、ベルリン地下鉄のUバーン(ウーバーン)、都市近郊電車のSバーン(エスバーン)、旧東ベルリン地域の路面電車(トラム)が運行されている。長距離列車は、ドイツ国内各地へのICEやインターシティ、パリ、ウィーン、東欧各国への列車が運行されている。東西分断時代は、西側がツォー(Zoo.動物園)駅、東側はベルリン東(Ost)駅がターミナルとなっており、2つのターミナルが併用されていた。2006年5月、東西のターミナルを統合した新しいベルリン中央駅が完成し、営業を開始している。